Když kníratí bráchové v jedničce zachránili rozkošnou princeznu Peach před zlým veleještěrem Bowserem, kterého proměnili v „maloještěra“ a neškodného domácího mazlíčka, mysleli si, že mají hotovo. Jenže videoherní fandové, kteří svět Super Mario Bros. dobře znají, vědí, že se v něm vyskytuje pár dalších jedinců schopných škodit. Jako například Bowser junior, kterému osud tatíka není vůbec lhostejný. Kromě jeho záchrany by rád s Luigim a Mariem srovnal účty, protože z krále mocné rasy Koopů si nikdo srandu dělat nebude. Zkrátka, oba instalatéři budou muset znovu navléct montérky a začít makat. Diváky ovšem čeká nekonečná zábava plná humoru a bláznivých nápadů, v níž se objeví staré známé tváře, ale také nové postavy, na které se v prvním díle nedostalo, například Yoshi, asi nejroztomilejší dinosaurus v dinosauří historii.